AlphaGenome adalah model AI terpadu yang memprediksi efek varian DNA pada regulasi gen dengan konteks panjang hingga 1 juta basa dan resolusi per huruf.
Memanfaatkan arsitektur konvolusi dan transformer yang dijalankan pada TPU untuk memproses sekuens panjang dan menghasilkan prediksi multimodal tentang ekspresi gen, splicing, aksesibilitas DNA, dan interaksi protein.
Dilatih menggunakan data dari konsorsium publik seperti ENCODE, GTEx, 4D Nucleome, dan FANTOM5 untuk mencakup berbagai tipe sel dan jaringan manusia dan tikus.
Mampu menilai dampak varian genetik dengan membandingkan prediksi sekuens asli dan termutasi dalam waktu singkat.
Mencapai performa unggul pada 22/24 tugas prediksi sekuens dan 24/26 tugas prediksi efek varian, melebihi model lain dan mencakup lebih banyak modalitas.
Model unifikasi ini memungkinkan peneliti menyelidiki berbagai aspek regulasi gen hanya dengan satu panggilan API, mempercepat penelitian.
Tersedia dalam pratinjau untuk riset non-komersial melalui AlphaGenome API, mendukung riset penyakit, biologi sintetis, dan pemetaan elemen fungsional.
Keterbatasan saat ini termasuk tantangan menangkap elemen regulasi sangat jauh (>100.000 basa), spesifisitas sel/tisu, dan belum divalidasi untuk tujuan klinis.
Get notified when new stories are published for "Berita Peretas 🇮🇩 Bahasa Indonesia"